Программу БОМКА, финансируюмую Европейским Союзом, реализует консорциум агентств по управлению границами определенных стран-членов Европейского Союза и Международный центр развития миграционной политики. Консорциум возглавляет Государственная пограничная охрана Латвийской Республики.
Эти партнеры реализуют четыре тематических компонента:
- Государственная пограничная охрана Латвийской Республики (Компонент 1)
- Государственная пограничная служба Литовской Республики (Компонент 2)
- Служба государственных доходов Латвийской Республики (Компонент 3)
- Международный центр по развитию миграционной политики (Компонент 4).
Общее руководство, стратегическое управление и мониторинг реализации компонентов в соответствии с описанием деятельности, включая логическую структуру и общую координацию, осуществляется в странах-членах ЕС.
Пять ассоциированных партнеров, представленных ниже, предоставляют консультации, экспертизу и делятся опытом согласно деятельности проекта в период его реализации:
- Министерство внутренних дел Венгрии;
- Центральное управление иммиграционной и пограничной полиции Итальянской Республики;
- Продовольственная и ветеринарная служба Латвийской Республики;
- Рижский технический университет;
- Пограничная служба Республики Польша.
Секретариат программы БОМКА находится в штаб-квартире Международного центра по развитию миграционной политики в Вене. Секретариат отвечает за финансовое, административное и техническое управление проектом.
Региональная структура в Центральной Азии координирует и занимается логистической организацией всей деятельности на национальном и региональном уровне. Она также поддерживает контакты с заинтересованными сторонами на экспертном уровне, собирает, анализирует и делится юридической, статистической и другой информацией, относящейся к содержанию проекта, с руководством проекта, руководством компонентов и секретариатом программы БОМКА.